出资协议与公司章程的法律关系:
（1）公司成立后，股东间协议在没有被修改、变更、解除，与公司章程内容也不相悖的情况下，其效力并不自然终止或被公司章程的效力所取代，法院需要根据具体个案情况判断如何适用，不存在以两者中哪个为准的问题。
（2）股东间协议的特别约定未记载入公司章程的，不得对抗善意第三人。
（3）股东间协议中的特别约定未记载入公司章程，公司成立后有新股东加入，全体新老股东共同签署的协议明确约定遵守原股东协议的，原股东协议的约定对全体股东均有约束力。